RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPARA	Q07869	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	TGFBI	Q15582	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PNMA3	Q9UL41	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ENC1	O14682	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALOX15B	O15296	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	TPPP	O94811	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ENPP1	P22413	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	MTFR1	Q15390	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159		F8W8V4	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PEX1	O43933	1283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZPR1	O75312	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHGB	P05060	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	FGFR1	P11362	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAGA	P17050	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	NLRP6	P59044	892 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CTBS	Q01459	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAB2	Q15742	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	NCAN	O14594	1321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159		H7C1D1	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSF2BP	O75031	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLD1	P28340	1107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	XIAP	P98170	497 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	ECM1	Q16610	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SLC38A9-222	ENST00000515159	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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