RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 MSL1Q68DK7 614 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ZPBP2Q6X784 338 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SPATA18Q8TC71 538 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TTC25Q96NG3 672 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NPTXRO95502 500 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SHMT1P34896 483 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 EPHB4P54760 987 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 KCTD1Q719H9 257 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RRAGAQ7L523 313 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ZNF410Q86VK4 478 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 STK33Q9BYT3 514 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NBPF3Q9H094 633 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RRN3Q9NYV6 651 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.32□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NDUFA10O95299 355 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TNNI1P19237 187 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 EFHBQ8N7U6 833 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 EXOC4Q96A65 974 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SNED1Q8TER0 1413 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RGS2P41220 211 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PIK3CAP42336 1068 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 STX17P56962 302 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 POU5F1BQ06416 359 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NME8Q8N427 588 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 INCENPQ9NQS7 918 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RNF181Q9P0P0 153 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 KRT7P08729 469 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GZMAP12544 262 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NOVP48745 357 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MYL6P60660 151 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CENPPQ6IPU0 288 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FAM71BQ8TC56 605 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MTMR8Q96EF0 704 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MBOAT7Q96N66 472 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 NR3C2P08235 984 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CYP2D6P10635 497 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CYP2C19P33261 490 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MCM6Q14566 821 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ACAP1Q15027 740 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ARMC3Q5W041 872 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PDXDC1Q6P996 788 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DYMQ7RTS9 669 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.31□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CLRN2A0PK11 232 aa6.3□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MYO1FO00160 1098 aa6.3□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MTSS1O43312 755 aa6.3□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SPAG6O75602 509 aa6.3□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GDF11O95390 407 aa6.3□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 KRT5P13647 590 aa6.3□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DNAJB2P25686 324 aa6.3□□□□□ -1.4
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