RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 SIP14410 1827 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 ASAP2O43150 1006 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 ERVK-21P61565 698 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 PDIA5Q14554 519 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM228AQ86W67 206 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 NACC1Q96RE7 527 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 MTRQ99707 1265 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 TMX1Q9H3N1 280 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 RGS18Q9NS28 235 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPRSQ13332 1948 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-210ENST00000505941 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 DRP2Q13474 957 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 NBR1Q14596 966 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 EMC2Q15006 297 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 NLRP4Q96MN2 994 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A087WZ62 844 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 DGAT1O75907 488 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 PPM1EQ8WY54 764 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM143Q96AN5 459 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 DACT1Q9NYF0 836 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 ZBTB39O15060 712 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 DGKIO75912 1065 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF15O94989 841 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 MUTP22033 750 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 RPA1P27694 616 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.49■■□□□ 1.35
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SH3BP2-210ENST00000505941 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 RFXAPO00287 272 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.48■■□□□ 1.35
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SH3BP2-210ENST00000505941 PRPHP41219 470 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 TFDP1Q14186 410 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRE1Q14246 886 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 BRAPQ7Z569 592 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 CHST12Q9NRB3 414 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC3P53804 2025 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 RARRES1P49788 294 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT79Q5XKE5 535 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 KSR1Q8IVT5 923 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM192Q8IY95 271 aa23.47■■□□□ 1.35
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SH3BP2-210ENST00000505941 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.47■■□□□ 1.35
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SH3BP2-210ENST00000505941 HOXA2O43364 376 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 MGEA5O60502 916 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 MED24O75448 989 aa23.46■■□□□ 1.35
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SH3BP2-210ENST00000505941 GRB10Q13322 594 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 EPC2Q52LR7 807 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 FERMT3Q86UX7 667 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 HSCBQ8IWL3 235 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 C9IYK1 514 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 RB1P06400 928 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-210ENST00000505941 SKIP12755 728 aa23.45■■□□□ 1.34
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