RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP1A3	P13637	1013 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	PBX1	P40424	430 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	NAMPT	P43490	491 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	EFNA5	P52803	228 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	NKX3-2	P78367	333 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	ADAM9	Q13443	819 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT31	Q15323	416 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	CNGA4	Q8IV77	575 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	DAW1	Q8N136	415 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	GJD2	Q9UKL4	321 aa		10.34	□□□□□ -0.75
LPIN3-204	ENST00000496565	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PMM2	O15305	246 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CCP110	O43303	1012 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TUBB4A	P04350	444 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	UGCG	Q16739	394 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	DGKD	Q16760	1214 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GLG1	Q92896	1179 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	UIMC1	Q96RL1	719 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	KCND1	Q9NSA2	647 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.33	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A1W2PQJ5	194 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565		A6NJR5	290 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ESPN	B1AK53	854 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	P4HA2	O15460	535 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	STX10	O60499	249 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARIH2	O95376	493 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PIGR	P01833	764 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP4A	P20648	1035 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GART	P22102	1010 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NR2F2	P24468	414 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TMOD1	P28289	359 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARL2	P36404	184 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CPT1A	P50416	773 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	HTRA3	P83110	453 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CRHR2	Q13324	411 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TFDP1	Q14186	410 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	EMC2	Q15006	297 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	VWA3B	Q502W6	1294 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PANX2	Q96RD6	677 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PCYT2	Q99447	389 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NDST4	Q9H3R1	872 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		10.32	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		10.31	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565		K7ENM7	598 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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