RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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USP40-217ENST00000496298 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.76■■□□□ 1.07
USP40-217ENST00000496298 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.76■■□□□ 1.07
USP40-217ENST00000496298 C4orf19Q8IY42 314 aa21.76■■□□□ 1.07
USP40-217ENST00000496298 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.76■■□□□ 1.07
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USP40-217ENST00000496298 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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USP40-217ENST00000496298 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.72■■□□□ 1.07
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USP40-217ENST00000496298 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP40-217ENST00000496298 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP40-217ENST00000496298 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.69■■□□□ 1.06
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