RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493792.1

TRAPPC12-222, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NME8	Q8N427	588 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RAD9A	Q99638	391 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KCNH6	Q9H252	994 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GJB5	O95377	273 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SYT1	P21579	422 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CD52	P31358	61 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LPIN1	Q14693	890 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ANO5	Q75V66	913 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EVPL	Q92817	2033 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A087WWV3	80 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZBTB39	O15060	712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DCX	O43602	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLITRK3	O94933	977 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	STBD1	O95210	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	AMH	P03971	560 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PAK2	Q13177	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	APBB2	Q92870	758 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OSMR	Q99650	979 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SI	P14410	1827 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LAD1	O00515	517 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RPS6KA5	O75582	802 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	UPP2	O95045	317 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	STX6	O43752	255 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MED24	O75448	989 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RFC5	P40937	340 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZP2	Q05996	745 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DRP2	Q13474	957 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EMC2	Q15006	297 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	POTEG	Q6S5H5	508 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.6	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms