RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492861.1

PKDCC-209, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-209	ENST00000492861	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	KAT2B	Q92831	832 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PSMA7	O14818	248 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ZEB2	O60315	1214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	HOXC8	P31273	242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PRCP	P42785	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861		A0A1W2PPC1	479 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MAGEB2	O15479	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PPP1R37	O75864	691 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	KIF20A	O95235	890 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	C22orf31	O95567	290 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	INSRR	P14616	1297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ABCD1	P33897	745 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ARL2	P36404	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MYL5	Q02045	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PAK1	Q13153	545 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MFSD10	Q14728	455 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PGK1	P00558	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PSEN2	P49810	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	NCKAP1L	P55160	1127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	BEX3	Q00994	111 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	NCAPH	Q15003	741 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	GRIK4	Q16099	956 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	IER5	Q5VY09	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKDCC-209	ENST00000492861	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-209	ENST00000492861	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-209	ENST00000492861		H0YCG3	227 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-209	ENST00000492861	CABYR	O75952	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-209	ENST00000492861	MYL3	P08590	195 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-209	ENST00000492861	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKDCC-209	ENST00000492861	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms