RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	FAM228A	Q86W67	206 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	TCP11	Q8WWU5	503 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	AK8	Q96MA6	479 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	PNMA5	Q96PV4	448 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	PBX4	Q9BYU1	374 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	TMX1	Q9H3N1	280 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ENPP3	O14638	875 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	CDC42EP1	Q00587	391 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	NLRP7	Q8WX94	980 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275		A0A087WZ62	844 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275		E9PMD0	336 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	GRB10	Q13322	594 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	GPR153	Q6NV75	609 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	KCNK18	Q7Z418	384 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	TTC3	P53804	2025 aa		28.72	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	BRD1	O95696	1058 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ARL2	P36404	184 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	PADI6	Q6TGC4	694 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF410	Q86VK4	478 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	NLRP4	Q96MN2	994 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	DNM3	Q9UQ16	869 aa		28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
TTC3-223	ENST00000492275	GPR182	O15218	404 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	EYA4	O95677	639 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	AMH	P03971	560 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MYOG	P15173	224 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	DNAJB2	P25686	324 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CABP7	Q86V35	215 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	SCLT1	Q96NL6	688 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CLIC6	Q96NY7	704 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	PLIN2	Q99541	437 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CSRNP2	Q9H175	543 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		28.7	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	ASAP2	O43150	1006 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MGEA5	O60502	916 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CYP11B2	P19099	503 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	FGFR4	P22455	802 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	ODR4	Q5SWX8	454 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	UBA7	P41226	1012 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	SPECC1	Q5M775	1068 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	USP49	Q70CQ1	688 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	TOP1MT	Q969P6	601 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	SLC26A4	O43511	780 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	GJB5	O95377	273 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	STK38	Q15208	465 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	RAB30	Q15771	203 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	TIFA	Q96CG3	184 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	EPSTI1	Q96J88	318 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	MSRA	Q9UJ68	235 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	GLRA2	P23416	452 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TTC3-223	ENST00000492275	DSC3	Q14574	896 aa		28.66	■■■□□ 2.18

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