RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490709.1

GLIS3-216, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 768 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-216ENST00000490709 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.73■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 CEP170P1Q96L14 293 aa22.73■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 REV3LO60673 3130 aa22.73■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 MCM7P33993 719 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 BMPR1AP36894 532 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 GATMP50440 423 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 PTPROQ16827 1216 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 TPH2Q8IWU9 490 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 C4orf19Q8IY42 314 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 ARID2Q68CP9 1835 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 C9IYK1 514 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 FGFR4P22455 802 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 CDC42EP1Q00587 391 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 ASB2Q96Q27 587 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-216ENST00000490709 A0A087WZ62 844 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 SLITRK3O94933 977 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 RB1P06400 928 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 LINC00271P0C7V0 271 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TFF2Q03403 129 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 DSC3Q14574 896 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 XKR9Q5GH70 373 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 IL27Q8NEV9 243 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 MTMR9Q96QG7 549 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF174Q15697 407 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 KSR1Q8IVT5 923 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 NLRP4Q96MN2 994 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 COG5Q9UP83 839 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 PPME1Q9Y570 386 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 ZBTB39O15060 712 aa22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 RFC5P40937 340 aa22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 ZNF410Q86VK4 478 aa22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 NEK9Q8TD19 979 aa22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 HLA-CQ95604 372 aa22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.68■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 POTEMA6NI47 508 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 CSPG5O95196 566 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 FAM189BP81408 668 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 AAK1Q2M2I8 961 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TTC38Q5R3I4 469 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TMEM143Q96AN5 459 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 PLVAPQ9BX97 442 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 GRM6O15303 877 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 FGFR1P11362 822 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 EMC2Q15006 297 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 RNF169Q8NCN4 708 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TMX3Q96JJ7 454 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 MTRQ99707 1265 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 KIF3AQ9Y496 699 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-216ENST00000490709 OR52Z1P0C646 297 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms