RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 OTUD6AQ7L8S5 288 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 PIGOQ8TEQ8 1089 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 GDPD5Q8WTR4 605 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 TMEM143Q96AN5 459 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 ADAM2Q99965 735 aa13.43□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 CUL9Q8IWT3 2517 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 A0A087WZ62 844 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 DENND3A2RUS2 1198 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 MED24O75448 989 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 GATMP50440 423 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 PTGDRQ13258 359 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 GRB10Q13322 594 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 CUL4AQ13619 759 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 EMC2Q15006 297 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 NEK9Q8TD19 979 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 SLC7A3Q8WY07 619 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 RGS18Q9NS28 235 aa13.42□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 LPXNO60711 386 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 DGKIO75912 1065 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 LYPLA2O95372 231 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 RFC5P40937 340 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 SARSP49591 514 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 DSC3Q14574 896 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 ODR4Q5SWX8 454 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 CATSPER3Q86XQ3 398 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 NPAS4Q8IUM7 802 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 CRIPAKQ8N1N5 446 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 NLRP4Q96MN2 994 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 LRFN2Q9ULH4 789 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 PPME1Q9Y570 386 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 MTCH2Q9Y6C9 303 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 ARID2Q68CP9 1835 aa13.41□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 C9IYK1 514 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 STAG3L1P0CL83 205 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 CDC42EP1Q00587 391 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 EPC2Q52LR7 807 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 POTEGQ6S5H5 508 aa13.4□□□□□ -0.26
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NISCH-214ENST00000490425 TMEM192Q8IY95 271 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 FIBCD1Q8N539 461 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 TUFT1Q9NNX1 390 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 ANKEF1Q9NU02 776 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 COL4A6Q14031 1691 aa13.4□□□□□ -0.26
NISCH-214ENST00000490425 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 RARRES1P49788 294 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 FAM189BP81408 668 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 IL17AQ16552 155 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 ECM1Q16610 540 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 ZNF410Q86VK4 478 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 ERMNQ8TAM6 284 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 TCP11Q8WWU5 503 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 MTRQ99707 1265 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 LRWD1Q9UFC0 647 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 PP2D1A8MPX8 630 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 USO1O60763 962 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 LINC00271P0C7V0 271 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 RPA1P27694 616 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 CTNNB1P35222 781 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-214ENST00000490425 RILPL1Q5EBL4 403 aa13.38□□□□□ -0.27
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