RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, human

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP6-208	ENST00000483859	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	DSE	Q9UL01	958 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859		B4E1Z4	1266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	SCD	O00767	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	TGM5	O43548	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	ERBB2	P04626	1255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	RRAD	P55042	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	STAT4	Q14765	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	CEP72	Q9P209	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859		H0Y858	1186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	FOXN1	O15353	648 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	CDC14B	O60729	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	KNG1	P01042	644 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	SLC9A1	P19634	815 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	CR2	P20023	1033 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	FLT3	P36888	993 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	IRF9	Q00978	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	DUSP8	Q13202	625 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	DHCR24	Q15392	516 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	MASP2	O00187	686 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	MATN2	O00339	956 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	FKBP9	O95302	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	NPTXR	O95502	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	EPHA5	P54756	1037 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	RAC3	P60763	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	FOXL1	Q12952	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	DLG3	Q92796	817 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SENP6-208	ENST00000483859	KRIT1	O00522	736 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	KATNA1	O75449	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	NUDT3	O95989	172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	SCNN1B	P51168	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	IL2	P60568	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SENP6-208	ENST00000483859	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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