RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 RIT2Q99578 217 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TPCN1Q9ULQ1 816 aa13.06□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 MYO10Q9HD67 2058 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 DENND3A2RUS2 1198 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 FSCN2O14926 492 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 HOXA2O43364 376 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 EDIL3O43854 480 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 GLP2RO95838 553 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 IFNAR1P17181 557 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CCT2P78371 535 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CDC42EP1Q00587 391 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 FAM228AQ86W67 206 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 RNF135Q8IUD6 432 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 SUSD6Q92537 303 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 EDAQ92838 391 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 IGFLR1Q9H665 355 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CWH43Q9H720 699 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TLR9Q9NR96 1032 aa13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 WDR64B1ANS9 1081 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 ADAMTS3O15072 1205 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 FGF18O76093 207 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 LAG3P18627 525 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TMOD1P28289 359 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFV1P49821 464 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 GATMP50440 423 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 KIZQ2M2Z5 673 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 RDM1Q8NG50 284 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TRAIPQ9BWF2 469 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TLE6Q9H808 572 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa13.04□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CPLX1O14810 134 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF862O60290 1169 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 PFKFB2O60825 505 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 EOMESO95936 686 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CYP3A7P24462 503 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 SFNP31947 248 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 NRIP1P48552 1158 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 ME3Q16798 604 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 DUSP6Q16828 381 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 PRR16Q569H4 304 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 SLC5A5Q92911 643 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 OSMRQ99650 979 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 DISC1Q9NRI5 854 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 NRBP2Q9NSY0 501 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 GABBR1Q9UBS5 961 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 GINS2Q9Y248 185 aa13.03□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 USP34Q70CQ2 3546 aa13.02□□□□□ -0.32
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0U1RQF3 1178 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 CARNS1A5YM72 827 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 MSH4O15457 936 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 VTNP04004 478 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 PPM1AP35813 382 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 JAK3P52333 1124 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 ERVFC1P60507 584 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 CLUL1Q15846 466 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 Q4G0T1 1027 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 LRRC55Q6ZSA7 311 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 HSCBQ8IWL3 235 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 METTL13Q8N6R0 699 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 NECAB1Q8N987 351 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 SNX21Q969T3 373 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 CASD1Q96PB1 797 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 MAP7D2Q96T17 732 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 S1PR5Q9H228 398 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 CHST12Q9NRB3 414 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 RNF19AQ9NV58 838 aa13.02□□□□□ -0.33
GARNL3-217ENST00000481875 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms