RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM259Q4ZIN3 620 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYDE2Q5VT97 1194 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HAUS5O94927 633 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYNE4Q8N205 404 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAPN11Q9UMQ6 739 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NR1H3Q13133 447 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEX33O43247 280 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BMP3P12645 472 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCD1P33897 745 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC37BQ96QE4 947 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS6KC1Q96S38 1066 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MED14O60244 1454 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C21orf2O43822 256 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERICH1Q86X53 443 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSTNP61366 133 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF19Q2TAC6 998 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPC5P78333 572 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALCAMQ13740 583 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDO1Q16878 200 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTERF2Q49AM1 385 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEDD4P46934 1319 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB7AO95365 584 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCND2P30279 289 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLC4Q9NSK0 619 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADRA2BP18089 450 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAV1Q03135 178 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FSCBQ5H9T9 825 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCTN4Q9UJW0 460 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYO1EQ12965 1108 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC14Q15048 493 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C16orf87Q6PH81 154 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLC2Q9H0B6 622 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLC3Q6P597 504 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.533e-7■■■□□ 16.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK36Q9NRP7 1315 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIP2AQ14689 1571 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STAT2P52630 851 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZDHHC9Q9Y397 364 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDR2Q01850 454 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PROM2Q8N271 834 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OXER1Q8TDS5 423 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPC25Q9HBM1 224 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ETNK1Q9HBU6 452 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GIPC2Q8TF65 315 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXT2Q93063 718 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC25Q96NG3 672 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAD23BP54727 409 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP2B1P63010 937 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINB13Q9UIV8 391 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPRUQ92729 1446 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP73A6NFT4 308 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR64B1ANS9 1081 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRAFP15056 766 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GUCY1A3Q02108 690 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MECOMQ03112 1051 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASGRF1Q13972 1273 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COG1Q8WTW3 980 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPDYE6P0CI01 402 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PYGBP11216 843 aa18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms