RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477939.1

TRA2B-211, Transcript of transformer 2 beta homolog, humanhuman

TSL 2

Gene TRA2B, Length 530 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2B-211ENST00000477939 ATG7O95352 703 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 SKIP12755 728 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 EDNRBP24530 442 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 S100A5P33763 92 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ACTN2P35609 894 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 MPP3Q13368 585 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TAF11Q15544 211 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 INAQ16352 499 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 BRAPQ7Z569 592 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TMEM110Q86TL2 294 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 RELL1Q8IUW5 271 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 WHAMMQ8TF30 809 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 HERVK_113Q902F9 699 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TBC1D5Q92609 795 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TRIM4Q9C037 500 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CPVLQ9H3G5 476 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 IL23AQ9NPF7 189 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 MCM8Q9UJA3 840 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 Q9Y3F1 56 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 GMEB1Q9Y692 573 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 SQORQ9Y6N5 450 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PTPRSQ13332 1948 aa6.5□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TRIM66O15016 1216 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PRC1O43663 620 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ZEB2O60315 1214 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 AP1G2O75843 785 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ARIH2O95376 493 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 FESP07332 822 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 SDSP20132 328 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CALML3P27482 149 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 KIF5BP33176 963 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.375e-10■■□□□ 12.8
TRA2B-211ENST00000477939 CCT8P50990 548 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CCL23P55773 120 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 HDAC4P56524 1084 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TBX4P57082 545 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TUBA3CQ13748 450 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ADGRE1Q14246 886 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PPP2R5BQ15173 497 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 USH1GQ495M9 461 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 Q4G0T1 1027 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 NXNQ6DKJ4 435 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TTC39CQ8N584 583 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 C3orf20Q8ND61 904 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 SUN5Q8TC36 379 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 RILPL2Q969X0 211 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 SCLYQ96I15 445 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 IL25Q9H293 177 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 SENP2Q9HC62 589 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CASS4Q9NQ75 786 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 DISC1Q9NRI5 854 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 MKS1Q9NXB0 559 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 CROTQ9UKG9 612 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TNKSO95271 1327 aa6.49□□□□□ -1.37
TRA2B-211ENST00000477939 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms