RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.26■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 CYP3A7P24462 503 aa22.25■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 MTERF2Q49AM1 385 aa22.24■■□□□ 1.15
COL9A3-210ENST00000472880 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.24■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 AIFM3Q96NN9 605 aa22.24■■□□□ 1.15
COL9A3-210ENST00000472880 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.24■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 LRRC43Q8N309 656 aa22.23■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 CWH43Q9H720 699 aa22.23■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 RNF169Q8NCN4 708 aa22.22■■□□□ 1.15
COL9A3-210ENST00000472880 MBOAT7Q96N66 472 aa22.22■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 CDC42EP1Q00587 391 aa22.21■■□□□ 1.15
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COL9A3-210ENST00000472880 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.2■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 XBP1P17861 261 aa22.2■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 DRP2Q13474 957 aa22.2■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF558Q96NG5 402 aa22.2■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 PER2O15055 1255 aa22.19■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 SLC37A4O43826 429 aa22.19■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 PLCB3Q01970 1234 aa22.19■■□□□ 1.14
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COL9A3-210ENST00000472880 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 PSMC5P62195 406 aa22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 DUSP6Q16828 381 aa22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 NEK8Q86SG6 692 aa22.18■■□□□ 1.14
COL9A3-210ENST00000472880 CEP89Q96ST8 783 aa22.18■■□□□ 1.14
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