RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 PDIA5Q14554 519 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 DUPD1Q68J44 220 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 POTEGQ6S5H5 508 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC25Q86WR0 208 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 JAMLQ86YT9 394 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB17Q9H0T7 212 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 ECT2Q9H8V3 914 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 GCNT4Q9P109 453 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 PNMA3Q9UL41 463 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 RPTORQ8N122 1335 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP73A6NFT4 308 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 AKAP3O75969 853 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 RARAP10276 462 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 CREB1P16220 341 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP11B2P19099 503 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 CDK8P49336 464 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 PTENP60484 403 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 ALG3Q92685 438 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 AFF2P51816 1311 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 RFC4P35249 363 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 SIX2Q9NPC8 291 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPC6Q9Y210 931 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC169A6NNP5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 KRT16P08779 473 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PLCG2P16885 1265 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 MARCKSL1P49006 195 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNA1Q09470 495 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ERICH1Q86X53 443 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 SNED1Q8TER0 1413 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT17P0C025 328 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 EPHA7Q15375 998 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ARSHQ5FYA8 562 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS36Q86VN1 386 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 SFR1Q86XK3 245 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PALB2Q86YC2 1186 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 BCS1LQ9Y276 419 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 EVI5O60447 810 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXD13P35453 343 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PSMC6P62333 389 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.072e-10■■■■□ 26.4
SH3BP1-206ENST00000469947 SLMAPQ14BN4 828 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 GDAP1Q8TB36 358 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PGM2Q96G03 612 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 NENFQ9UMX5 172 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 SNX3O60493 162 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 MED24O75448 989 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 RSPH10BP0C881 870 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC16A2P36021 539 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ADCY1Q08828 1119 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL29Q96CT2 875 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNQ2O43526 872 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms