RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ITGB1P05556 798 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM20AQ96MK3 541 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCLT1Q96NL6 688 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CEP89Q96ST8 783 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EML1O00423 815 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM189BP81408 668 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPP2R5CQ13362 524 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DRP2Q13474 957 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CAMK1Q14012 370 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CLDND1Q9NY35 253 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FGFR1P11362 822 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IL9P15248 144 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAJB1P25685 340 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PSMC5P62195 406 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HYAL1Q12794 435 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NLRP7Q8WX94 980 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM205CA6NFA0 338 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TBX3O15119 743 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NCK2O43639 380 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRT2P35908 639 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NEK4P51957 841 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NR5A1Q13285 461 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ANO5Q75V66 913 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HAS1Q92839 578 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HCSTQ9UBK5 93 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SEC24BO95487 1268 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FGFR4P22455 802 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POF1BQ8WVV4 589 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TNFRSF25Q93038 417 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AAASQ9NRG9 546 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RNF19AQ9NV58 838 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 JAK2O60674 1132 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IRS1P35568 1242 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LTBRP36941 435 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNM2P50570 870 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CDC42EP1Q00587 391 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HOXA2O43364 376 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MARCH6O60337 910 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LXNQ9BS40 222 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IGFLR1Q9H665 355 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CWH43Q9H720 699 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CD320Q9NPF0 282 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A087WZ62 844 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TBX10O75333 385 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LAG3P18627 525 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FOSBP53539 338 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NPEPPSP55786 919 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UBE3AQ05086 875 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ST3GAL1Q11201 340 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms