RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TRIM66O15016 1216 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 GALCP54803 685 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 IQCKQ8N0W5 287 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 WHAMMQ8TF30 809 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SCFD2Q8WU76 684 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 INTUQ9ULD6 942 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.162e-6■■■□□ 15.5
IMP4-208ENST00000460766 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 UBE4BO95155 1302 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 GNGT1P63211 74 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 VCPKMTQ9H867 229 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 KCND2Q9NZV8 630 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
IMP4-208ENST00000460766 ZNF233A6NK53 670 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 KRIT1O00522 736 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 EXOC3O60645 756 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 HIP1RO75146 1068 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 LMNB1P20700 586 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ERVK-9P63128 1117 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 DLGAP5Q15398 846 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 LDHDQ86WU2 507 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MREGQ8N565 214 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 FAM151AQ8WW52 585 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 VEZTQ9HBM0 779 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 DMAC2Q9NW81 257 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ATP8B3O60423 1300 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 C21orf2O43822 256 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 RAD17O75943 681 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ABCB4P21439 1286 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MUTP22033 750 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MYL7Q01449 175 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ISCUQ9H1K1 167 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R5AQ15172 486 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 HOOK2Q96ED9 719 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 K7ENM7 598 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 GUCY2CP25092 1073 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 NPEPPSP55786 919 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 BFSP1Q12934 665 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 FAM160B2Q86V87 743 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 GPR88Q9GZN0 384 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ITGA4P13612 1032 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 OGFOD1Q8N543 542 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 AMFRQ9UKV5 643 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 LRRN2O75325 713 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ITGB5P18084 799 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 ATP1A2P50993 1020 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 PADI6Q6TGC4 694 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-208ENST00000460766 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.23■■□□□ 1.15
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