RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL13Q8N6R0 699 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 EFHBQ8N7U6 833 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 BICD2Q8TD16 824 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CASD1Q96PB1 797 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIT2Q99578 217 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGFLR1Q9H665 355 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.55□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 EML1O00423 815 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR182O15218 404 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEB2O15479 319 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHMP2AO43633 222 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 NCK2O43639 380 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC37A4O43826 429 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAS7O60861 476 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGF18O76093 207 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEXIO95424 95 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGFR4P22455 802 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRIP1P48552 1158 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 NLRP5P59047 1200 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCRN1Q12765 414 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 BLIDQ8IZY5 108 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM167AQ96KS9 214 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD207Q9UJ71 328 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACNA1HO95180 2353 aa9.54□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 DENND3A2RUS2 1198 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR33A8MZF0 331 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCXO43602 365 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTDNEP1O95476 244 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SFNP31947 248 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 PBX3P40426 434 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 JAK3P52333 1124 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE3AQ05086 875 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 COASYQ13057 564 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK3Q13188 491 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 DUSP6Q16828 381 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 INF2Q27J81 1249 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ODR4Q5SWX8 454 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANO5Q75V66 913 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 RDM1Q8NG50 284 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 TLR9Q9NR96 1032 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAV3Q9UKW4 847 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKT3Q9Y243 479 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 SAMM50Q9Y512 469 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK36Q9NRP7 1315 aa9.53□□□□□ -0.88
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM205CA6NFA0 338 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PER2O15055 1255 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 B4GALT3O60512 393 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 LARGE1O95461 756 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFV1P49821 464 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCB3Q01970 1234 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTERF2Q49AM1 385 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GAPDHP28-201ENST00000455134 OXER1Q8TDS5 423 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms