RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CASP10Q92851 521 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TMEM117Q9H0C3 514 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TMX1Q9H3N1 280 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 FSCN2O14926 492 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 PER2O15055 1255 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ATG7O95352 703 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TMOD1P28289 359 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 AVPR2P30518 371 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TECP42680 631 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 NLRP5P59047 1200 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ITIH3Q06033 890 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 MTMR3Q13615 1198 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 MCTP2Q6DN12 878 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD54Q6NXT1 300 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 NECAB1Q8N987 351 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ASIC4Q96FT7 647 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TCF25Q9BQ70 676 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ZNF302Q9NR11 478 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 CFAP54Q96N23 3096 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 C9IYK1 514 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB2O15479 319 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 PFKFB2O60825 505 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 DEXIO95424 95 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 LARGE1O95461 756 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 GNA11P29992 359 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 RABEP1Q15276 862 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 PDXDC2PQ6P474 469 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ZNF558Q96NG5 402 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 MAP7D2Q96T17 732 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 SORCS3Q9UPU3 1222 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ESYT2A0FGR8 921 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 MEIS1O00470 390 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS3O15072 1205 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 SREBF1P36956 1147 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 MTHFRP42898 656 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ERVFC1P60507 584 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TMC7Q7Z402 723 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 METTL13Q8N6R0 699 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 BICD2Q8TD16 824 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 FAM167AQ96KS9 214 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 RIPOR3Q96MK2 946 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 AIFM3Q96NN9 605 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ZMYND12Q9H0C1 365 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 SPG21Q9NZD8 308 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ARP10275 920 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 FOSBP53539 338 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 FAM189BP81408 668 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 GIT2Q14161 759 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ME3Q16798 604 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 KIZQ2M2Z5 673 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 KCNT2Q6UVM3 1135 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 ABHD15Q6UXT9 468 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 OSMRQ99650 979 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 S1PR5Q9H228 398 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 DZANK1Q9NVP4 752 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 DACT1Q9NYF0 836 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-210ENST00000442481 PLXNA3P51805 1871 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 MGEA5O60502 916 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 PSAPP07602 524 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 XBP1P17861 261 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 CDC42EP1Q00587 391 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 KCNC3Q14003 757 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 FAM228AQ86W67 206 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-210ENST00000442481 KREMEN2Q8NCW0 462 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms