RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 SLC6A3Q01959 620 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 TOMM22Q9NS69 142 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 GPR39O43194 453 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 ZEB2O60315 1214 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 ULK1O75385 1050 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 BPIP17213 487 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CR2P20023 1033 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 LSSP48449 732 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 SELENOPP49908 381 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 CEP89Q96ST8 783 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 MUSKO15146 869 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRC-208ENST00000427110 PRLP01236 227 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 MEOX1P50221 254 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 ANTXR2P58335 489 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 ITKQ08881 620 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 DUSP8Q13202 625 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 ZMAT1Q5H9K5 638 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-208ENST00000427110 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.33□□□□□ -1.88
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