RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 UPP2O95045 317 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SLC34A2O95436 690 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 CA3P07451 260 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-205ENST00000426683 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.1■□□□□ 0.81
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HERC3-205ENST00000426683 MTRQ99707 1265 aa20.1■□□□□ 0.81
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HERC3-205ENST00000426683 GUCD1Q96NT3 240 aa20.09■□□□□ 0.81
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HERC3-205ENST00000426683 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.09■□□□□ 0.81
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HERC3-205ENST00000426683 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.05■□□□□ 0.8
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HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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HERC3-205ENST00000426683 RNF149Q8NC42 400 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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HERC3-205ENST00000426683 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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HERC3-205ENST00000426683 CERS4Q9HA82 394 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 DNM3Q9UQ16 869 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 ARID2Q68CP9 1835 aa20.04■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 E9PMD0 336 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 STAG3L1P0CL83 205 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 GRIN1Q05586 938 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.03■□□□□ 0.8
HERC3-205ENST00000426683 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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