RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425048.1

LINC01040-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1040, humanhuman

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Gene LINC01040, Length 666 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01040-201ENST00000425048 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 C2orf78A6NCI8 922 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 MAN2A2P49641 1150 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 Q6ZRM9 215 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 GAREM2Q75VX8 874 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 IGSF22Q8N9C0 903 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 AGAP2Q99490 1192 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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LINC01040-201ENST00000425048 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.37□□□□□ -1.23
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LINC01040-201ENST00000425048 BPIFB4P59827 614 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 SLC25A3Q00325 362 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 ROM1Q03395 351 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 DGKDQ16760 1214 aa7.37□□□□□ -1.23
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LINC01040-201ENST00000425048 TMEM177Q53S58 311 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 GPHA2Q96T91 129 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 BOCQ9BWV1 1114 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 XDHP47989 1333 aa7.36□□□□□ -1.23
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LINC01040-201ENST00000425048 TGM1P22735 817 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 FNTBP49356 437 aa7.36□□□□□ -1.23
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LINC01040-201ENST00000425048 ANTXR2P58335 489 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 OTOP1Q7RTM1 612 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 TCF25Q9BQ70 676 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 TTPALQ9BTX7 342 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 UBE2QL1A1L167 161 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 FOXN1O15353 648 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 KRT4P19013 534 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 SLC6A3Q01959 620 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 TCIRG1Q13488 830 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 RASA3Q14644 834 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 GAGE13Q4V321 117 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 PTGS2P35354 604 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 RGS3P49796 1198 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 ADAM8P78325 824 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 PCSK4Q6UW60 755 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 Q6ZPA2 131 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 BRAPQ7Z569 592 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 HAS1Q92839 578 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 MAML3Q96JK9 1138 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 DNAJC7Q99615 494 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 GPR87Q9BY21 358 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC01040-201ENST00000425048 TRAF5O00463 557 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 RPS6KA4O75676 772 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 KRT37O76014 449 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 PRLP01236 227 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 SERINC3Q13530 473 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 ACSS2Q9NR19 701 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 DAPK3O43293 454 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 MFAP3LO75121 409 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 KIF11P52732 1056 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 RBL2Q08999 1139 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 MFSD5Q6N075 450 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 JMYQ8N9B5 988 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 WDR92Q96MX6 357 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 IL23AQ9NPF7 189 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 SNTG2Q9NY99 539 aa7.32□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 TTC38Q5R3I4 469 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 KRT40Q6A162 431 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 CLEC14AQ86T13 490 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.31□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 B4E1Z4 1266 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 CYP17A1P05093 508 aa7.3□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINC01040-201ENST00000425048 FSTL1Q12841 308 aa7.3□□□□□ -1.24
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