RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424263.6

PRDM11-201, Transcript of PR/SET domain 11, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene PRDM11, Length 1,858 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM11-201ENST00000424263 TIPINQ9BVW5 301 aa22.11■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.1■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 TMOD1P28289 359 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 AMPD3Q01432 767 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 RPAINQ86UA6 219 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 ARL2P36404 184 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 KANK3Q6NY19 840 aa22.09■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 DYMQ7RTS9 669 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 RSPH10BP0C881 870 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 CASP1P29466 404 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 DNM2P50570 870 aa22.08■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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PRDM11-201ENST00000424263 MAP7D2Q96T17 732 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 POLD4Q9HCU8 107 aa22.08■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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PRDM11-201ENST00000424263 VTNP04004 478 aa22.07■■□□□ 1.12
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PRDM11-201ENST00000424263 THPOP40225 353 aa22.05■■□□□ 1.12
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PRDM11-201ENST00000424263 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 PNOCQ13519 176 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 CAPSQ13938 189 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 KSR1Q8IVT5 923 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.05■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 TET1Q8NFU7 2136 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 PITPNM1O00562 1244 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 GPR32O75388 356 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 FAM13AO94988 1023 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 CKBP12277 381 aa22.04■■□□□ 1.12
PRDM11-201ENST00000424263 MGAT3Q09327 533 aa22.04■■□□□ 1.12
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