RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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PTPRJ-201ENST00000418331 EPHA7Q15375 998 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP55Q53EZ4 464 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-201ENST00000418331 HDAC11Q96DB2 347 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRJ-201ENST00000418331 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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PTPRJ-201ENST00000418331 RCN2Q14257 317 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRJ-201ENST00000418331 DIP2AQ14689 1571 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRJ-201ENST00000418331 DBN1Q16643 649 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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