RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 STK17AQ9UEE5 414 aa9.01□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 GRIN2DO15399 1336 aa9.01□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 CLDN3O15551 220 aa9.01□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 CYP26A1O43174 497 aa9.01□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 PPP2R2AP63151 447 aa9.01□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 DLG4P78352 724 aa9.01□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 PPP2R5AQ15172 486 aa9.01□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 TMED2Q15363 201 aa9.01□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 FAM86B2P0C5J1 330 aa9□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 KLRC3Q07444 240 aa9□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 TPCN2Q8NHX9 752 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 DNAJC19Q96DA6 116 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 TCP11X1B4DZS4 312 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 PDHA1P08559 390 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 CTNNA2P26232 953 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 NPEPPSP55786 919 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 PEX3P56589 373 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 MEI1Q5TIA1 1274 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 WDR78Q5VTH9 848 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 CCDC33Q8N5R6 958 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 LRRN4Q8WUT4 740 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 LRRC27Q9C0I9 530 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 NARFQ9UHQ1 456 aa9□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 KRT15P19012 456 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 OSTNP61366 133 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 KYNUQ16719 465 aa8.99□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 CSRNP1Q96S65 589 aa8.99□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 C4BP0C0L5 1744 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 ATRNO75882 1429 aa8.99□□□□□ -0.97
SNX13-201ENST00000409076 SPEF2Q9C093 1822 aa8.99□□□□□ -0.97
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SNX13-201ENST00000409076 CD58P19256 250 aa8.99□□□□□ -0.97
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