RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 USP49Q70CQ1 688 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM143Q96AN5 459 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 EPSTI1Q96J88 318 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 PLIN2Q99541 437 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 DNM3Q9UQ16 869 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 SQORQ9Y6N5 450 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXD12-202ENST00000406506 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PADI6Q6TGC4 694 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 TCP11Q8WWU5 503 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 SEPT8Q92599 483 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CALML4Q96GE6 196 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 BAIAP3O94812 1187 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PLCG1P19174 1290 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 KRT85P78386 507 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 USP38Q8NB14 1042 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 LRRC15Q8TF66 581 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 APBB2Q92870 758 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 SCLT1Q96NL6 688 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ZBBXA8MT70 800 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CD52P31358 61 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 TXLNAP40222 546 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CDC42EP1Q00587 391 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF410Q86VK4 478 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 KSR1Q8IVT5 923 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 NLRP7Q8WX94 980 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 TTC3P53804 2025 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CUTAO60888 179 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CYP11B2P19099 503 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PAK2Q13177 524 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 NLRP4Q96MN2 994 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PADI3Q9ULW8 664 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 A0A087WZ62 844 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 EFCAB14O75071 495 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 RPS6KA5O75582 802 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ARL2P36404 184 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ME1P48163 572 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 IKBKEQ14164 716 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 FAM228AQ86W67 206 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 ASAP2O43150 1006 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 PLA2G4BP0C869 781 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 SLC12A3P55017 1021 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 SPATA32Q96LK8 384 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD12-202ENST00000406506 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
HOXD12-202ENST00000406506 GLRA2P23416 452 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD12-202ENST00000406506 KCNJ6P48051 423 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD12-202ENST00000406506 CAPSQ13938 189 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD12-202ENST00000406506 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD12-202ENST00000406506 SHC4Q6S5L8 630 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD12-202ENST00000406506 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms