RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 OCA2Q04671 838 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TTC17Q96AE7 1141 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 COX16Q9P0S2 106 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRM-202ENST00000400053 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.48□□□□□ -0.89
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