RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 LINC01565O15544 149 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 KPNA6O60684 536 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 PLA2G6O60733 806 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 GGPS1O95749 300 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 CXCL10P02778 98 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 ADH1AP07327 375 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 RSPH10BP0C881 870 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 MX1P20591 662 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 IRS1P35568 1242 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 ZP2Q05996 745 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 PWP1Q13610 501 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 TLR1Q15399 786 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 STXBP2Q15833 593 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 TIGD5Q53EQ6 642 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC62Q6P9F0 684 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 BTNL9Q6UXG8 535 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 FBXO11Q86XK2 927 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 HOMER1Q86YM7 354 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 DNERQ8NFT8 737 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 IL31RAQ8NI17 732 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 ATP6V0A1Q93050 837 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 SPATA33Q96N06 139 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 RCAN3Q9UKA8 241 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 INSL6Q9Y581 213 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa5.53□□□□□ -1.52
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC171Q6TFL3 1326 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 B4DLN1 442 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 GRM6O15303 877 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ORC4O43929 436 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 TBX10O75333 385 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 F2P00734 622 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 FGAP02671 866 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 GHRP10912 638 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 NDUFV1P49821 464 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 C8orf34Q49A92 452 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 FAM26DQ5JW98 314 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 FCHSD1Q86WN1 690 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM192Q8IY95 271 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 FIBCD1Q8N539 461 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 PRSS33Q8NF86 280 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 NEK9Q8TD19 979 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 RILPL2Q969X0 211 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 SNX27Q96L92 541 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 APOL5Q9BWW9 433 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 KAT14Q9H8E8 782 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 PXMP2Q9NR77 195 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 SETD4Q9NVD3 440 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 TELO2Q9Y4R8 837 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ABCB11O95342 1321 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 TECTAO75443 2155 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 B4E1Z4 1266 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 H3BNC9 293 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 STXBP3O00186 592 aa5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
TMLHE-202ENST00000369439 DNAJC6O75061 913 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms