RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360286.2

SUDS3-201, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-201ENST00000360286 DNM2P50570 870 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 EMC2Q15006 297 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 KIZQ2M2Z5 673 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ARSHQ5FYA8 562 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 IER5Q5VY09 327 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RESP18Q5W5W9 173 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ADALQ6DHV7 355 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RSPH3Q86UC2 560 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM199Q8N511 208 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RASSF8Q8NHQ8 419 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RAD54LQ92698 747 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 STAMQ92783 540 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 DHX58Q96C10 678 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 OSMRQ99650 979 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GINS2Q9Y248 185 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 PPME1Q9Y570 386 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.14□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 LTBP2Q14767 1821 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CAND2O75155 1236 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GHRP10912 638 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 PFKFB1P16118 471 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 FGFR4P22455 802 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GLRA2P23416 452 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CMA1P23946 247 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 TXLNAP40222 546 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 STAT6P42226 847 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GPC3P51654 580 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 FPGSQ05932 587 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 LPIN1Q14693 890 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 E2F4Q16254 413 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF365Q70YC5 407 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 TCP11Q8WWU5 503 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 NLRP7Q8WX94 980 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 BSNDQ8WZ55 320 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 MAP7D2Q96T17 732 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GDF15Q99988 308 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 IL23AQ9NPF7 189 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 SIP14410 1827 aa7.13□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 MYH11P35749 1972 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 A0A1W2PQ27 194 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 A0A1W2PQ64 194 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 A0A1W2PQD8 194 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 MYMKA6NI61 221 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 M0QZ92 97 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 ASAP2O43150 1006 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 HIP1RO75146 1068 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 FGBP02675 491 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CXCL10P02778 98 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CASP1P29466 404 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CD52P31358 61 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 RFC2P35250 354 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 NDUFA8P51970 172 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 CAPSQ13938 189 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 GIT2Q14161 759 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 SHHQ15465 462 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 LONRF3Q496Y0 759 aa7.12□□□□□ -1.27
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM240Q5SV17 173 aa7.12□□□□□ -1.27
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