RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 PRDM12Q9H4Q4 367 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 CERS4Q9HA82 394 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 ANKEF1Q9NU02 776 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 LRWD1Q9UFC0 647 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 PPME1Q9Y570 386 aa30.12■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 DARSP14868 501 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 RPA1P27694 616 aa30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 CDC25AP30304 524 aa30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 ERMNQ8TAM6 284 aa30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP4Q96MN2 994 aa30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 EVPLQ92817 2033 aa30.11■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 LAD1O00515 517 aa30.1■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 DNM2P50570 870 aa30.1■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 FTHL17Q9BXU8 183 aa30.1■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 EPOPA6NHQ4 379 aa30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 GPR182O15218 404 aa30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 DTHD1Q6ZMT9 781 aa30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 SNX29Q8TEQ0 813 aa30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 MTRQ99707 1265 aa30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa30.09■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 USO1O60763 962 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 PDIA5Q14554 519 aa30.08■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 HAUS3Q68CZ6 603 aa30.08■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 CRIPAKQ8N1N5 446 aa30.08■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 ADAM2Q99965 735 aa30.08■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TPGS1-201ENST00000359315 LINC01553A4QN01 128 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 RFXAPO00287 272 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 DSC3Q14574 896 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 YME1L1Q96TA2 773 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 CDH23Q9H251 3354 aa30.07■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 VWA3AA6NCI4 1184 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 STX6O43752 255 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRE1Q14246 886 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF410Q86VK4 478 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF710Q8N1W2 664 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ASAP3Q8TDY4 903 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 NACC1Q96RE7 527 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 IFT122Q9HBG6 1241 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 GPRC5CQ9NQ84 441 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 INSL6Q9Y581 213 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 CLIC4Q9Y696 253 aa30.06■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 COL4A6Q14031 1691 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 CHD9Q3L8U1 2897 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 DGAT1O75907 488 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 GATMP50440 423 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN1Q05586 938 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 MAEAQ7L5Y9 396 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ARNTL2Q8WYA1 636 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 RGS18Q9NS28 235 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 MTUS1Q9ULD2 1270 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1024Q9UPX6 916 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ARID2Q68CP9 1835 aa30.05■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 GAS2O43903 313 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa30.04■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ODR4Q5SWX8 454 aa30.04■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 EXOC8Q8IYI6 725 aa30.04■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 TCP11Q8WWU5 503 aa30.04■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 RAB34Q9BZG1 259 aa30.04■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 MINDY3Q9H8M7 445 aa30.04■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 DENND3A2RUS2 1198 aa30.03■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 C9IYK1 514 aa30.03■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 FOSL2P15408 326 aa30.03■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 KCNK18Q7Z418 384 aa30.03■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 NPAS4Q8IUM7 802 aa30.03■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 DGKIO75912 1065 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 MUTP22033 750 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ARL2P36404 184 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 SARSP49591 514 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 CDC42EP1Q00587 391 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 PTPAQ15257 358 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 KRT79Q5XKE5 535 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 PADI6Q6TGC4 694 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 RNF149Q8NC42 400 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 C17orf80Q9BSJ5 609 aa30.02■■■□□ 2.4
TPGS1-201ENST00000359315 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
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