RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 NR1I3Q14994 352 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 TMED2Q15363 201 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 MTRQ99707 1265 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 EPC1Q9H2F5 836 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 PDXKO00764 312 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 RASGRF2O14827 1237 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 SUN1O94901 812 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 FDX1P10109 184 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 IFT88Q13099 833 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 SAAL1Q96ER3 474 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ENTPD3O75355 529 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.29■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 MYMKA6NI61 221 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 NR1D1P20393 614 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 DMTNQ08495 405 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 CHP1Q99653 195 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ACAD9Q9H845 621 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 A0A1B0GUA9 196 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 CCNYQ8ND76 341 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ARL4AP40617 200 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 TMEM270Q6UE05 265 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 SAT1P21673 171 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 TBK1Q9UHD2 729 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 SNX24Q9Y343 169 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 SLIT1O75093 1534 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 KCNJ6P48051 423 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 SRGNP10124 158 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ACTN1P12814 892 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 FGFR2P21802 821 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 PPP4CP60510 307 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 PDE1BQ01064 536 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 KRT39Q6A163 491 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 PASD1Q8IV76 773 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NISCH-201ENST00000345716 PODXLO00592 558 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PSMA2P25787 234 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 MSH2P43246 934 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 EMSYQ7Z589 1322 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SCYL1Q96KG9 808 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZWILCHQ9H900 591 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CPP00450 1065 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 METTL23Q86XA0 190 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.26■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PTPAQ15257 358 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PLAAQ9Y263 795 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SMARCA1P28370 1054 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CASP7P55210 303 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ADGRB2O60241 1585 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TBX3O15119 743 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 GYS2P54840 703 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PRPSAP1Q14558 356 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 HMGCS2P54868 508 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZNF699Q32M78 642 aa22.24■■□□□ 1.15
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