RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF18P17022 549 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF394Q53GI3 561 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TIPINQ9BVW5 301 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TECPR2O15040 1411 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF28PB7ZC32 967 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 EFNA5P52803 228 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ASPHQ12797 758 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PDIK1LQ8N165 341 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 S100BP04271 92 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DR1Q01658 176 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf54Q08AI8 447 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TFDP2Q14188 446 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 WHAMMQ8TF30 809 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ANAPC7Q9UJX3 599 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GPC4O75487 556 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCY1A2P33402 732 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN26Q16670 478 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM270Q6UE05 265 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF280CQ8ND82 737 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX3O15119 743 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 AP3M2P53677 418 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 GPC5P78333 572 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF20Q9BVI0 1012 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 VCPKMTQ9H867 229 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3C2BO00750 1634 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC53A6NM62 1247 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TJP3O95049 919 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 HAUS6Q7Z4H7 955 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCC1Q9HA90 598 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZWINTO95229 277 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPY1Q01534 308 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR29P0C7W0 189 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS12P25398 132 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF449Q6P9G9 518 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC8A2Q9UPR5 921 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 RASA1P20936 1047 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 KYAT1Q16773 422 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 FMO2Q99518 471 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD16Q68DU8 428 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC13Q8NBP0 860 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 HDAC11Q96DB2 347 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K14Q99558 947 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ANO9A1A5B4 782 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMYND10O75800 440 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 STAT5BP51692 787 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 IRX4P78413 519 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC17AQ6ZS10 378 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ELP3Q9H9T3 547 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 TLK1Q9UKI8 766 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 SUN1O94901 812 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 CDO1Q16878 200 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBED2Q9BTP6 218 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP42A6NI28 874 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC26A4O43511 780 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 FGGP02679 453 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 CUL1Q13616 776 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 XKR3Q5GH77 459 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 POLD4Q9HCU8 107 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 SMYD2Q9NRG4 433 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 ASNSD1Q9NWL6 643 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 USP32Q8NFA0 1604 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 PODXLO00592 558 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIN3BO60391 1043 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNP10599 105 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-201ENST00000344528 GPD1LQ8N335 351 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms