RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 MAGEB2O15479 319 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 ASGR1P07306 291 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 GRIK4Q16099 956 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 KLRC1P26715 233 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 PEX3P56589 373 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 RTP1P59025 263 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 FIZ1Q96SL8 496 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 SETD4Q9NVD3 440 aa24.46■■□□□ 1.51
CTU2-201ENST00000312060 NRCAMQ92823 1304 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PSMA7O14818 248 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 GCNT3O95395 438 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 C22orf31O95567 290 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 ARL2P36404 184 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 IQCB1Q15051 598 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 RETREG2Q8NC44 543 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 TCP11Q8WWU5 503 aa24.45■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 FSD2A1L4K1 749 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 CASP5P51878 434 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 SMTNP53814 917 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MTFR1Q15390 333 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 IER5Q5VY09 327 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 LUZP1Q86V48 1076 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 METTL13Q8N6R0 699 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 IFT74Q96LB3 600 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 BRCA2P51587 3418 aa24.44■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 BECN2A8MW95 431 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 KIF20AO95235 890 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MYBP10242 640 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 STX17P56962 302 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PAK1Q13153 545 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 DRP2Q13474 957 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 NELFBQ8WX92 580 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 BSNDQ8WZ55 320 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 CCDC169A6NNP5 214 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 NPTX2P47972 431 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 DNM2P50570 870 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 C7orf31Q8N865 590 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.43■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 SMTNL1A8MU46 457 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 K7ENM7 598 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 CCL5P13501 91 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 GLRA2P23416 452 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 RNF208Q9H0X6 261 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.42■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 TMOD1P28289 359 aa24.41■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 CLCN3P51790 818 aa24.41■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 NCKAP1LP55160 1127 aa24.41■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 MYL5Q02045 173 aa24.41■■□□□ 1.5
CTU2-201ENST00000312060 PPP2R5AQ15172 486 aa24.41■■□□□ 1.5
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