RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 EMC10Q5UCC4 262 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANO7Q6IWH7 933 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 STMN2Q93045 179 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PWWP2AQ96N64 755 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCNT4Q9P109 453 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP3K13O43283 966 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT15P19012 456 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GNA11P29992 359 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ICA1Q05084 483 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRB10Q13322 594 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CUL3Q13618 768 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS52Q8N1B4 723 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIK3C2AO00443 1686 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 YY1P25490 414 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALDH3A1P30838 453 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC55Q6ZSA7 311 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf54Q8WWF1 131 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PIGSQ96S52 555 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PICK1Q9NRD5 415 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAEPP09466 180 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 TLCD1Q96CP7 247 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 AK8Q96MA6 479 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNA3P22001 575 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRPHP41219 470 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 AHCYL1O43865 530 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ETS2P15036 469 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2SQ16763 222 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf72Q96LT7 481 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NSMFQ6X4W1 530 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPOCK2Q92563 424 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RCAN1P53805 252 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.133e-14■□□□□ 8.1
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 GNAQP50148 359 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RASSF2P50749 326 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 BNIP1Q12981 228 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MTM1Q13496 603 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFAP157Q5JU67 520 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NT5DC3Q86UY8 548 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCNJLQ8IV13 435 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPAS1Q99814 870 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 CALB2P22676 271 aa15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIP2AQ14689 1571 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 RASA4BC9J798 803 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 RASA4O43374 803 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC37A4O43826 429 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 AFPP02771 609 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADCY8P40145 1251 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 MARCKSL1P49006 195 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 CYP4A11Q02928 519 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAD54LQ92698 747 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 RGL1Q9NZL6 768 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 CFAP69A5D8W1 941 aa15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1-201ENST00000300213 GCNT3O95395 438 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms