RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 KPNA7A9QM74 516 aa25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 CHGBP05060 677 aa25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 SUN2Q9UH99 717 aa25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 NOP14P78316 857 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 GCLMP48507 274 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 NT5C2P49902 561 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHB1P54762 984 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF139Q8WU17 664 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 USP6P35125 1406 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX33O43247 280 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGDIAP52565 204 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB18Q99592 522 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L5A8MUK1 530 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 E9PMD0 336 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRNA3P32297 505 aa25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ARPP19P56211 112 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 NCLNQ969V3 563 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 DCTN4Q9UJW0 460 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 H7C1W4 665 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 JAK3P52333 1124 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF394Q53GI3 561 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF4Q8WV16 495 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 BRAFP15056 766 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 COPS2P61201 443 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6B3Q8NGW1 331 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 PDLIM2Q96JY6 352 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ASNSD1Q9NWL6 643 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 PRELPP51888 382 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.79■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 METP08581 1390 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA13P27216 316 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BRJ5 948 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 AP2B1P63010 937 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TFDP2Q14188 446 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP4Q96MN2 994 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS11Q9H270 941 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM33Q9UPN9 1127 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC26A0AVF1 554 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 CREB3O43889 395 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 CALB1P05937 261 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2D6P10635 497 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 NBPF3Q9H094 633 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 GTSE1Q9NYZ3 720 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ARFIP2P53365 341 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 LY9Q9HBG7 655 aa25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM167BQ9BTA0 163 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 MARK3P27448 753 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf87Q6PH81 154 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM187AA6NFU0 413 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 OCA2Q04671 838 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC14Q15048 493 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB5O15062 677 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 SNF8Q96H20 258 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC24A3Q9HC58 644 aa25.77■■□□□ 1.72
GNPTAB-201ENST00000299314 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM270Q6UE05 265 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM161BQ96MY7 647 aa25.76■■□□□ 1.71
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF37A1IGU5 675 aa25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms