RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289577.9

TMED4-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMED4, Length 2,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4-201ENST00000289577 FAM228AQ86W67 206 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PGM2Q96G03 612 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 STK33Q9BYT3 514 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 GGA1Q9UJY5 639 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PNMA2Q9UL42 364 aa22.1■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 RSPH10BP0C881 870 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 AP3B2Q13367 1082 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 Q4G0T1 1027 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 STK24Q9Y6E0 443 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.09■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 TGFB1I1O43294 461 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 C21orf2O43822 256 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ARHGAP4P98171 946 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 NEDD9Q14511 834 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 LENG9Q96B70 501 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 HVCN1Q96D96 273 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 MEIS2O14770 477 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 CLIC2O15247 247 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 SHBGP04278 402 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 MMP13P45452 471 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 KCNA1Q09470 495 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 NFIL3Q16649 462 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PRR16Q569H4 304 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.08■■□□□ 1.13
TMED4-201ENST00000289577 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 PPIP5K2O43314 1243 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 PMS2P54278 862 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CLUL1Q15846 466 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 GPR88Q9GZN0 384 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 GCNT3O95395 438 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 NEK9Q8TD19 979 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.07■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ASAP2O43150 1006 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 TRIM37O94972 964 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CHN1P15882 459 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CNBD1Q8NA66 436 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 GLG1Q92896 1179 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 MGRN1O60291 552 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 JAMLQ86YT9 394 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 FAM20AQ96MK3 541 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.06■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CCDC169A6NNP5 214 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 GAP43P17677 238 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 VCAM1P19320 739 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 PTGIRP43119 386 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 FMO5P49326 533 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 MAPK7Q13164 816 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 DENND2CQ68D51 928 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 EYA4O95677 639 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 COPB2P35606 906 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ITIH4Q14624 930 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 SLC15A2Q16348 729 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 ALG3Q92685 438 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 VAV3Q9UKW4 847 aa22.04■■□□□ 1.12
TMED4-201ENST00000289577 MMEP08473 750 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms