RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 ENPP3O14638 875 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 DGAT1O75907 488 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 DNM2P50570 870 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 MTRQ99707 1265 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WZ62 844 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KA5O75582 802 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 MYOGP15173 224 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ARL2P36404 184 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 GRB10Q13322 594 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A14Q15043 492 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.83■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CDH23Q9H251 3354 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 E9PMD0 336 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 MGEA5O60502 916 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 BRD1O95696 1058 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB2P25686 324 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ6P48051 423 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CDC42EP1Q00587 391 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 PAK2Q13177 524 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CRIPAKQ8N1N5 446 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 LRRC15Q8TF66 581 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 AK8Q96MA6 479 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TTC3P53804 2025 aa24.82■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TOP1MTQ969P6 601 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 USO1O60763 962 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 GJB5O95377 273 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 FGFR4P22455 802 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 BECN1Q14457 450 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 DSC3Q14574 896 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 PADI6Q6TGC4 694 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 USP49Q70CQ1 688 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ZNF410Q86VK4 478 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TCP11Q8WWU5 503 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 NLRP7Q8WX94 980 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CLIC6Q96NY7 704 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CSRNP2Q9H175 543 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.8■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 GPR182O15218 404 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ASAP2O43150 1006 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 EYA4O95677 639 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CYP11B2P19099 503 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 Q7L0L9 218 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CABP7Q86V35 215 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 PLIN2Q99541 437 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 DNM3Q9UQ16 869 aa24.79■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF15O94989 841 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 AMHP03971 560 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 GLRA2P23416 452 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 SPECC1Q5M775 1068 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 EPSTI1Q96J88 318 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 NLRP4Q96MN2 994 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.78■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 DDIT3P35638 169 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 RAB30Q15771 203 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 TIFAQ96CG3 184 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.77■■□□□ 1.56
SYF2-201ENST00000236273 POLD4Q9HCU8 107 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms