RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CIITAP33076 1130 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TECP42680 631 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP11P51784 963 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NUBP1P53384 320 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERVFC1P60507 584 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KRT76Q01546 638 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCYT2Q99447 389 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BACH2Q9BYV9 841 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GINS2Q9Y248 185 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRR16Q569H4 304 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 S1PR5Q9H228 398 aa21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DENND3A2RUS2 1198 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PROB1E7EW31 1015 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FSCN2O14926 492 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FOSBP53539 338 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLCB4Q15147 1175 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NME8Q8N427 588 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HCSTQ9UBK5 93 aa21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EDIL3O43854 480 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MGEA5O60502 916 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM29Q14134 588 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADAM2Q99965 735 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NR2E1Q9Y466 385 aa21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RPS6KA5O75582 802 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LAG3P18627 525 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KRT2P35908 639 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STAT5BP51692 787 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ACTR2P61160 394 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTMR3Q13615 1198 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNC3Q14003 757 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INF2Q27J81 1249 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OXER1Q8TDS5 423 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCF25Q9BQ70 676 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LZTS1Q9Y250 596 aa21.32■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RGS18Q9NS28 235 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRR23AA6NEV1 266 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C9IYK1 514 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ODR4Q5SWX8 454 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LENG9Q96B70 501 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLXNA3P51805 1871 aa21.3■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HIDE1A8MVS5 230 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATG7O95352 703 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TDP2O95551 362 aa21.29■■□□□ 1
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FGFR1P11362 822 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms