RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174113.7

Sumo3-209, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Sumo3, Length 512 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Col25a1Q99MQ5 666 aa21.61■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 ZwintQ9CQU5 252 aa21.61■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tube1Q9D6T1 475 aa21.61■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tbc1d2B1AVH7 922 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CgnP59242 1191 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Trappc10Q3TLI0 1259 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc17a8Q8BFU8 601 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 FtoQ8BGW1 502 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 EtnpplQ8BWU8 499 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Emc2Q9CRD2 297 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Krt17Q9QWL7 433 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Stxbp4Q9WV89 557 aa21.6■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cyp26c1B2RXA7 518 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Per1O35973 1291 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sbk1Q8QZX0 417 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tspan8Q8R3G9 235 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Olfr395Q8VGR3 312 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pramel1Q99MW3 458 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa21.59■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 PtproE9Q612 1226 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Aff3P51827 1254 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 DsppP97399 934 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dennd1bQ3U1T9 766 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mier3Q3UHF3 551 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hook2Q7TMK6 716 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tmem220Q8BP07 167 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ftsj1Q8CBC7 324 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nkx2-4Q9EQM3 354 aa21.58■■□□□ 1.05
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Plxna4Q80UG2 1893 aa21.58■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ttll6A4Q9E8 822 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 mt-Co3P00416 261 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tnni3P48787 211 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pnpla5Q32LZ8 432 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sema5bQ60519 1093 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nudt16Q6P3D0 195 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 PoliQ6R3M4 717 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Trim68Q8K243 485 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cep57l1Q8VDS7 400 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mfsd5Q921Y4 450 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fbxo17Q9QZM8 286 aa21.57■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zfp472B0V2W5 534 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 G430095P16RikE9Q913 147 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc16a2O70324 545 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 DhpsQ3TXU5 369 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nrg1Q6DR99 700 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cyth4Q80YW0 393 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc38a7Q8BWH0 463 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rint1Q8BZ36 792 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dnajc28Q8VCE1 385 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tspyl4Q8VD63 406 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tomm70Q9CZW5 611 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Krtap5-3Q9D226 196 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CtsfQ9R013 462 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Scn5aQ9JJV9 2019 aa21.56■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vmn2r87E9PZX4 848 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pkn1P70268 946 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CiitaP79621 1155 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 P4ha1Q60715 534 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 IgflQ6B9Z0 140 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Prkag3Q8BGM7 489 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 KyQ8C8H8 661 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Kcnq4Q9JK97 696 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Peg12Q9WVA7 283 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Morc1Q9WVL5 950 aa21.55■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm6583E9Q8Z1 469 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Xrcc6P23475 608 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cdh15P33146 784 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Upf3aQ3ULJ3 422 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Wdr44Q6NVE8 915 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Proser3Q7TSA6 634 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Trit1Q80UN9 467 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fbxo46Q8BG80 603 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tmem117Q8BH18 514 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fam160b1Q8CDM8 764 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Upb1Q8VC97 393 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Unc93b1Q8VCW4 598 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Plagl2Q925T4 496 aa21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Map7d2A2AG50 781 aa21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Pex10B1AUE5 324 aa21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm4841E9QAA8 417 aa21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Camk4P08414 469 aa21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Epha2Q03145 977 aa21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Oas1fQ14AZ4 364 aa21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Usp13Q5BKP2 858 aa21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp1r13bQ62415 1087 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.2 ms