RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 GcP21614 476 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lta4hP24527 611 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Paxbp1P58501 919 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dpcr1Q3TNW5 500 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Six2Q62232 296 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ddr2Q62371 854 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 VillQ91YD6 859 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klra17Q9JMA4 273 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tlr2Q9QUN7 784 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atad5Q4QY64 1826 aa25.29■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gba2Q69ZF3 918 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp943Q6NZP4 507 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Igfbp4P47879 254 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Agxt2Q3UEG6 513 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Capn13Q3UW68 665 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 NntQ61941 1086 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 SelpQ01102 768 aa25.27■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sh3d21Q7TSG5 549 aa25.27■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trnp1Q80ZI1 223 aa25.27■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem161bQ8C2L6 487 aa25.27■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nrbp2Q91V36 499 aa25.27■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tlr5Q9JLF7 859 aa25.27■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sass6Q80UK7 654 aa25.27■■□□□ 1.64
Suds3-201ENSMUST00000086471 Spryd7Q3TFQ1 196 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccpg1Q640L3 753 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmigd3G3X8R9 209 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ces1eQ64176 562 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ece2Q80Z60 881 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 TbckQ8BM85 762 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stap2Q8R0L1 411 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 FignQ9ERZ6 759 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa25.26■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp3caP63328 521 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Miga1Q4QQM5 600 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Drc7Q6V3W6 876 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pkn2Q8BWW9 983 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Map1sQ8C052 973 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pop1Q8K205 1045 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sdr42e1Q9D665 394 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wfdc16A2A5H4 111 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam129cD3YZB0 591 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnu1O54982 1121 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nptx2O70340 429 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mt-CybP00158 381 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pgk2P09041 417 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 TxnP10639 105 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dclk3Q8BWQ5 790 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dbndd2Q9CRD4 158 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tbx20Q9ES03 445 aa25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prr14lE9Q7C4 1971 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gucy1b3O54865 620 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 HunkO88866 714 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Muc3aQ3U5A2 218 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cep70Q6IQY5 616 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 MafaQ8CF90 359 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 PrameQ9D4Z5 464 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mmp15O54732 657 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q66JV7 365 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Med15Q924H2 789 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mxra8Q9DBV4 442 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 IydQ9DCX8 285 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Usp29Q9ES63 869 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sbno2Q7TNB8 1349 aa25.24■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zfp457L7N1X4 647 aa25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tpd52Q62393 224 aa25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrrn2Q6PHP6 730 aa25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 AsphQ8BSY0 741 aa25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Phldb2Q8K1N2 1249 aa25.23■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Timm44O35857 452 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mrgprb1Q3UG61 350 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr18Q4VBE8 431 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sema4bQ62179 823 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Styk1Q6J9G1 429 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Elmo3Q8BYZ7 720 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fthl17aQ9DAX0 182 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rabgap1A2AWA9 1064 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 StamP70297 548 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cfap52Q5F201 620 aa25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.4 ms