RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bag1Q60739 355 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ctnna3Q65CL1 895 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nacc1Q7TSZ8 514 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mei4Q8BRM6 389 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mdm4O35618 489 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Serpina1eQ00898 413 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ddx4Q61496 702 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aoc2Q812C9 757 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep95Q8BVV7 827 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trib2Q8K4K3 343 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GldcQ91W43 1025 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Med15Q924H2 789 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem206Q9D771 350 aa19.95■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf784Q8BI69 297 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q8C5C9 218 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wrap53Q8VC51 532 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gimap3Q99MI6 301 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cmtr1Q9DBC3 837 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pidd1Q9ERV7 915 aa19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krt28A6BLY7 462 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Etnk2A7MCT6 385 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ugt1a8D3Z748 530 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ugt1a10E9PXN7 530 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Oog4Q4G0C7 502 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Icam5Q60625 917 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chtf18Q8BIW9 969 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnc4Q8R1C0 628 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Reep2Q8VCD6 254 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Smtnl1Q99LM3 459 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klhl40Q9D783 621 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc89Q9DA73 370 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 LctF8VPT3 1931 aa19.93■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Skor2A7M7C7 1008 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klhl33G3UW92 533 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chrna9G3X8Z7 479 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mtco1P00397 514 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Phka1P18826 1241 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 LxnP70202 222 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mkrn3Q60764 544 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tpm4Q6IRU2 248 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prpf40bQ80W14 870 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Acot11Q8VHQ9 594 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lpin2Q99PI5 893 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spint1Q9R097 507 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm10378F6XQQ1 160 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Irf8P23611 424 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 WasP70315 520 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Drp2Q05AA6 957 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp37Q8C0R0 979 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SucoQ8C341 1250 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sgms1Q8VCQ6 419 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr395Q8VGR3 312 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BrdtQ91Y44 956 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Grpel1Q99LP6 217 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Galnt15Q9D2N8 638 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mfap3lQ9D3X9 409 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Klhl10Q9D5V2 608 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa19.92■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GclmO09172 274 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tp53P02340 387 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tnni3P48787 211 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Adcy7P51829 1099 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp2c39P56656 490 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Frat1P70339 274 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Acot5Q6Q2Z6 421 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ankrd24Q80VM7 985 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem161bQ8C2L6 487 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mamdc2Q8CG85 686 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Otud6bQ8K2H2 294 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CtsqQ91ZF4 343 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa19.91■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21973F6WEZ7 68 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm9857F7CXR1 130 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccr1P51675 355 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp781Q0P5U5 243 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Frmd8Q3UFK8 466 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 DeptorQ570Y9 409 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rps6ka5Q8C050 863 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MafaQ8CF90 359 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Prmt7Q922X9 692 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ndst4Q9EQW8 872 aa19.9■□□□□ 0.78
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.9 ms