RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PIN2	Q12057	282 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	ATP14	Q12349	124 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MHT1	Q12525	324 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	SRN2	Q99176	213 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PET54	P10834	293 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	TFS1	P14306	219 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	KIN3	P22209	435 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	SSO1	P32867	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YPT7	P32939	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	TIP20	P33891	701 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MED6	P38782	295 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
RPT4	YOR259C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	ZRG8	P40021	1076 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	FMC1	P40491	155 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	IME4	P41833	600 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	GAT1	P43574	510 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	IRC7	P43623	340 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	CHA4	P43634	648 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	BIT61	P47041	543 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	ECM27	P47144	725 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	NBP35	P52920	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	ERV29	P53337	310 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PRM1	P53835	661 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YNL260C	P53846	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YNL140C	P53910	189 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MRPS16	Q02608	121 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YHM2	Q04013	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YLR283W	Q05867	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	BUR2	Q05949	395 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YPR114W	Q06107	315 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YLR446W	Q06204	433 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	ARV1	Q06541	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	GPN3	Q06543	272 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	FRE5	Q08908	694 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YPL066W	Q12194	479 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PST1	Q12355	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MRX4	Q12467	430 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PHO5	P00635	467 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MER1	P16523	270 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	HXT2	P23585	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MNE1	P24720	663 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
RPT4	YOR259C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	STE5	P32917	917 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YBR063C	P38083	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	UBA4	P38820	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	FET3	P38993	636 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MBP1	P39678	833 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MEP1	P40260	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	GDS1	P41913	522 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	MNT2	P53059	558 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	SLI1	P53304	468 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	BUD17	P53727	317 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	GOR1	P53839	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YPL068C	Q02749	293 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	TRM82	Q03774	444 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	VID22	Q05934	901 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YLR036C	Q07986	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	DIN7	Q12086	430 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PER33	Q12144	273 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YPR011C	Q12251	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	APC2	Q12440	853 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	SIR2	P06700	562 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YAR066W	P0CX18	203 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	BAR1	P12630	587 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	HCM1	P25364	564 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PDR3	P33200	976 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PXA2	P34230	853 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YKL097C	P34245	136 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	YKL107W	P34251	309 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PHO11	P35842	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	PHO12	P38693	467 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT4	YOR259C	RRF1	P38771	230 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 143 ms