RNA–Protein interactions for RNA: YGR093W

DRN1, Transcript of Splicing factor that modulates turnover of branched RNAs by Dbr1p, yeast

Gene DRN1, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRN1	YGR093W	YIL001W	P40560	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	PHB1	P40961	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	UBX6	P47049	396 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	AIM22	P47051	409 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	ATG34	Q12292	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	ATP4	P05626	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	STE7	P06784	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YCR102C	P25608	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	GTO1	P48239	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	ESA1	Q08649	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	GET4	Q12125	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	CRC1	Q12289	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	ADH7	P25377	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	PTC1	P35182	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	CAF4	P36130	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	MNN2	P38069	597 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YBL029W	P38201	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	PTR3	P43606	678 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	NAS6	P50086	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	IRC15	Q02733	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	SSO1	P32867	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	DOA1	P36037	715 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YBR139W	P38109	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
DRN1	YGR093W	TAF6	P53040	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	MRM2	P53123	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	COG2	P53271	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	ECM11	Q04110	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	SEC17	P32602	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	PTR2	P32901	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	OM14	P38325	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	HSM3	P38348	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	AIM2	P39721	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	IDS2	P46958	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YGR067C	P53243	804 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YEH2	Q07950	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	UAF30	Q08747	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	SAS5	Q99314	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	CBS2	P14905	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	STP22	P25604	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	MSN2	P33748	704 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	VPS51	P36116	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	IFA38	P38286	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	TRR2	P38816	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	IRC7	P43623	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	GOR1	P53839	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	GLO2	Q05584	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	GMC2	Q06201	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	VPS74	Q06385	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YEH1	Q07804	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	SGT1	Q08446	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	REX3	Q12090	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	DAP2	P18962	818 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	GPI12	P23797	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	YBR062C	P38239	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DRN1	YGR093W	FES1	P38260	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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