RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W NDD1Q08887 554 aa12□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YDL176WQ12027 708 aa12□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SCH9P11792 824 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W AAC3P18238 307 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YCR061WP25639 631 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ECM25P32525 599 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W CSE2P33308 149 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W CCZ1P38273 704 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RCY1P39531 840 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W IDS2P46958 469 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TAD2P47058 250 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W DUS1P53759 423 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YNL260CP53846 198 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RGT2Q12300 763 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W COX3P00420 269 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W NAM9P27929 486 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ATP11P32453 318 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SPO23P33757 523 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PMT1P33775 817 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W MTC2P34246 357 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TUL1P36096 758 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YIL077CP40508 320 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W OAZ1Q02803 292 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ODC1Q03028 310 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RPN4Q03465 531 aa11.99□□□□□ -0.49
SSA4YER103W AFT1P22149 690 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W MET22P32179 357 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W GLN1P32288 370 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W CIN1P40987 1014 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W DCR2Q05924 578 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SSK1Q07084 712 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YLR036CQ07986 203 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YAR066WP0CX18 203 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YHR214WP0CX19 203 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W CDC23P16522 626 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W HOP1P20050 605 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W LDS1P31379 325 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PHO11P35842 467 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PHO12P38693 467 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W IKI1P38874 309 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PNT1P38969 423 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YIL024CP40543 189 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RPL10P41805 221 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W MCM22P47167 239 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ATF2P53296 535 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PIR3Q03180 325 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ELP6Q04868 273 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ARR2Q06597 130 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SRN2Q99176 213 aa11.98□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-DR6P0CX70 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-ER1P0CX71 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-LR2P0CX72 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-PLP0CX73 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-JR1P0CX74 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-LR3P0CX75 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-ML2P0CX76 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W EMP24P32803 203 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YBR071WP38243 211 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RTC2P38279 296 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W MAD2P40958 196 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YGL159WP53110 370 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W BSC5P53755 489 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RNH202Q05635 350 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W IPK1Q06667 281 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YPR084WQ06821 456 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ZEO1Q08245 113 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-GR1Q12085 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W EAF3Q12432 401 aa11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SSA4YER103W STE12P13574 688 aa11.96□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SSA4YER103W UTP25P40498 721 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SSA4YER103W LOH1P47055 219 aa11.96□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PRP24P49960 444 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SSA4YER103W VMA9Q3E7B6 73 aa11.96□□□□□ -0.49
SSA4YER103W CAR2P07991 424 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MRPL8P22353 238 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YPT52P36018 234 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YHL026CP38740 315 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SEN34P39707 275 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W POP1P41812 875 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MOG1P47123 218 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W PMT5P52867 743 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SAY1P53324 424 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W ANT1Q06497 328 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W CDA2Q06703 312 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W YPR011CQ12251 326 aa11.96□□□□□ -0.5
SSA4YER103W MIH1P23748 554 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W SIP1P32578 815 aa11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W CDC13P32797 924 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SSA4YER103W TCM62P38228 572 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
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