RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624		A0A0G2JND7	137 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	DNM1L	O00429	736 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	COPB2	P35606	906 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CENPK	Q9BS16	269 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	XDH	P47989	1333 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	FAM13A	O94988	1023 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	QPCT	Q16769	361 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GJA10	Q969M2	543 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	LRRN2	O75325	713 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GNA14	O95837	355 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SLC29A2	Q14542	456 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ZNF711	Q9Y462	761 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GCNT3	O95395	438 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MMP10	P09238	476 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SERPINB6	P35237	376 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KCNJ2	P63252	427 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CDR2	Q01850	454 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ORC4	O43929	436 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	UST	Q9Y2C2	406 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RASA4B	C9J798	803 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	RASA4	O43374	803 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TRADD	Q15628	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624		A0A087X0B3	334 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	C21orf2	O43822	256 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	UFL1	O94874	794 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	MYL1	P05976	194 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ATF2	P15336	505 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PLCG2	P16885	1265 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PSMD6	Q15008	389 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	CEP72	Q9P209	647 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PXN-222	ENST00000637624	TMEM120B	A0PK00	339 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	ECEL1	O95672	775 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	GYS1	P13807	737 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	PSMC4	P43686	418 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	GLG1	Q92896	1179 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PXN-222	ENST00000637624	DCTN3	O75935	186 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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