RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF174	Q15697	407 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	C4orf19	Q8IY42	314 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPM1E	Q8WY54	764 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	DYDC2	Q96IM9	177 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP170P1	Q96L14	293 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	LXN	Q9BS40	222 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	BACH2	Q9BYV9	841 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SZT2	Q5T011	3432 aa		18.57	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	DENND3	A2RUS2	1198 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM150B	A6NC51	233 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR32	O75388	356 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	STAG3L1	P0CL83	205 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAPPC10	P48553	1259 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP4A11	Q02928	519 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC38	Q5R3I4	469 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCTP1	Q6DN14	999 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANO5	Q75V66	913 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEK9	Q8TD19	979 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	NLRP7	Q8WX94	980 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	RGL1	Q9NZL6	768 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPME1	Q9Y570	386 aa		18.56	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01553	A4QN01	128 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFXAP	O00287	272 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	STBD1	O95210	358 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	GJB2	P29033	226 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTMR9	Q96QG7	549 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		18.55	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	WNT7A	O00755	349 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGEF15	O94989	841 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR52Z1	P0C646	297 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPC3	P51654	580 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPEPPS	P55786	919 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERVK-21	P61565	698 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADGRE1	Q14246	886 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	XKR9	Q5GH70	373 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	FIBCD1	Q8N539	461 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAMD11	Q96NU1	681 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAM2	Q99965	735 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	EVPL	Q92817	2033 aa		18.54	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLITRK3	O94933	977 aa		18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	18.53	■□□□□ 0.56	1e-7	■■□□□ 12.4
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFC5	P40937	340 aa		18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEC	P42680	631 aa		18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERMN	Q8TAM6	284 aa		18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		18.53	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM228A	Q86W67	206 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCP11	Q8WWU5	503 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP89	Q96ST8	783 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMX1	Q9H3N1	280 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPRS	Q13332	1948 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR81	Q562E7	1941 aa		18.52	■□□□□ 0.56
JMJD1C-211	ENST00000633035	POTEM	A6NI47	508 aa		18.51	■□□□□ 0.55

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