RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 S1PR5Q9H228 398 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIS1O00470 390 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC27A2O14975 620 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 VTNP04004 478 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TYW1BQ6NUM6 668 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SWSAP1Q6NVH7 229 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 ABI1Q8IZP0 508 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM117Q9H0C3 514 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 CA8P35219 290 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SYCE2Q6PIF2 218 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC7Q7Z402 723 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G4DQ86XP0 818 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF558Q96NG5 402 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SMCO2A6NFE2 343 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 HIDE1A8MVS5 230 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA2O43364 376 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 SREBF1P36956 1147 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PBX3P40426 434 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCB3Q01970 1234 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT17Q04695 432 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 AP3B2Q13367 1082 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNT2Q6UVM3 1135 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF169Q8NCN4 708 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 NR2E1Q9Y466 385 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 C22orf31O95567 290 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1AP35813 382 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC43Q8N309 656 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP10Q92851 521 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-217ENST00000629983 H0Y858 1186 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM189BP81408 668 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TPRNQ4KMQ1 711 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CREB3L3Q68CJ9 461 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 NIPA1Q7RTP0 329 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 KREMEN2Q8NCW0 462 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RASGRP4Q8TDF6 673 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GY48 417 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB42B2RXF5 422 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNC3Q14003 757 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RTN1Q16799 776 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CES5AQ6NT32 575 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SGMS1Q86VZ5 419 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX2Q8IWB9 1127 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RIPOR3Q96MK2 946 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CASD1Q96PB1 797 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 GLT8D2Q9H1C3 349 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH22Q9UJ99 828 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 AKT3Q9Y243 479 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa31.05■■■□□ 2.56
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CAPNS1-217ENST00000629983 CLCN3P51790 818 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 DSC3Q14574 896 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 APOA5Q6Q788 366 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP7D2Q96T17 732 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF577Q9BSK1 485 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SPG21Q9NZD8 308 aa31.05■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 KMT2EQ8IZD2 1858 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM86B1E9PN63 330 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 hCG_1984214I3L0E3 225 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM86B2P0C5J1 330 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP4AP20648 1035 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR3Q13615 1198 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC55Q6ZSA7 311 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 BARHL2Q9NY43 387 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SCLT1Q96NL6 688 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO2Q9NQ90 1003 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP131Q9UPN4 1083 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB43O43298 467 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ECHDC2Q86YB7 292 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 NECTIN4Q96NY8 510 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 POMKQ9H5K3 350 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF19AQ9NV58 838 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SORCS3Q9UPU3 1222 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-217ENST00000629983 C2CD4DB7Z1M9 353 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX15O43143 795 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 PSAPP07602 524 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 CLK2P49760 499 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 UBALD2Q8IYN6 164 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM87AQ8NBN3 555 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D22BQ9NU19 505 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-217ENST00000629983 GABBR1Q9UBS5 961 aa31.01■■■□□ 2.55
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