RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 VTNP04004 478 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 ZNF174Q15697 407 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 NEK9Q8TD19 979 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 DYDC2Q96IM9 177 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 HSD17B14Q9BPX1 270 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 FTHL17Q9BXU8 183 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 CDHR5Q9HBB8 845 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 RGL1Q9NZL6 768 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 PADI3Q9ULW8 664 aa27.89■■■□□ 2.06
PMS1-220ENST00000618056 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 GINS2Q9Y248 185 aa27.89■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 TMEM40Q8WWA1 233 aa27.88■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 CYP26B1Q9NR63 512 aa27.88■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 AKT3Q9Y243 479 aa27.88■■■□□ 2.05
PMS1-220ENST00000618056 ENPP3O14638 875 aa27.87■■■□□ 2.05
PMS1-220ENST00000618056 LYPLA2O95372 231 aa27.87■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 INSL6Q9Y581 213 aa27.87■■■□□ 2.05
PMS1-220ENST00000618056 H3BQV1 296 aa27.86■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 ODR4Q5SWX8 454 aa27.86■■■□□ 2.05
PMS1-220ENST00000618056 OTUD6AQ7L8S5 288 aa27.86■■■□□ 2.05
PMS1-220ENST00000618056 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.86■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 ADAMTS10Q9H324 1103 aa27.86■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 POTEMA6NI47 508 aa27.85■■■□□ 2.05
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF15O94989 841 aa27.85■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 LINC01599Q8WXQ3 324 aa27.85■■■□□ 2.05
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PMS1-220ENST00000618056 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PMS1-220ENST00000618056 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
PMS1-220ENST00000618056 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
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