RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC31Q6UY01 552 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 PCGF5Q86SE9 256 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 ALX1Q15699 326 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 LY9Q9HBG7 655 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 SLC12A1Q13621 1099 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 HACL1Q9UJ83 578 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 PPME1Q9Y570 386 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TTC4O95801 387 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 BARHL2Q9NY43 387 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 RWDD2BP57060 319 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 COG7P83436 770 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.67■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 MTMR2Q13614 643 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.66■■□□□ 1.06
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CTDP1-208ENST00000613122 MT-ND3P03897 115 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 POTEB3A0JP26 581 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 POTECB2RU33 542 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 POTEBQ6S5H4 581 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 AKR1B1P15121 316 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 CXCR5P32302 372 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 GCLMP48507 274 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 KRT31Q15323 416 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 VSTM4Q8IW00 320 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GUA9 196 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 EPHB4P54760 987 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 MED4Q9NPJ6 270 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
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CTDP1-208ENST00000613122 PROM2Q8N271 834 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.65■■□□□ 1.06
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CTDP1-208ENST00000613122 BAG2O95816 211 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 NNMTP40261 264 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 FOXO4P98177 505 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM270Q6UE05 265 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 LXNQ9BS40 222 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 COASYQ13057 564 aa21.64■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 BBS9Q3SYG4 887 aa21.64■■□□□ 1.06
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFA10O95299 355 aa21.64■■□□□ 1.05
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 GLI2P10070 1586 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TJP3O95049 919 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PAMP19021 973 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf54Q08AI8 447 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 RABGGTAQ92696 567 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TTI1O43156 1089 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 FIS1Q9Y3D6 152 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 UBE4BO95155 1302 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SLMAPQ14BN4 828 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ORC4O43929 436 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 CALB1P05937 261 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 ADCY1Q08828 1119 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KLC3Q6P597 504 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 MID2Q9UJV3 735 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.63■■□□□ 1.05
CTDP1-208ENST00000613122 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.63■■□□□ 1.05
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